Az ELIXIR segítségével létrejött tudományos közlemények

Az ELIXIR több módon segíti tudományos projektek megvalósítását:

  1. hazai és nemzetközi oktatások szervezésével,
  2. bioinformatikai módszertani betanítással,
  3. programok és élettudmonáyi adatbázisok fenntartásával,
  4. felhő alapú elemző kiszolgálók biztosításával,
  5. technológiai fejlesztésekkel,
  6. és egy európai szintű kollaborációs hálózat biztosításán keresztül.

 

Ezek felhasználásával az ELIXIR Magyarország kutatói által készült tudományos közlemények listája:

 

Gombos Katalin, Földi Mária, Kiss Szabolcs, Herczeg Róbert, Gyenesei Attila., Geiger Lili, Csabai Dávid, Futács Krisztina, Nagy Tamás, Miseta Attila, Somogyi Balázs Antal, Hegyi Péter, Szentesi Andrea (2021) : Analysis of COVID-19-related RT-qPCR test results in Hungary: Epidemology, dianostics and clinical outcome . Frontiers in Medicine, 2021. 

Gombos Katalin, Herczeg Róbert, Erőss Bálint, Kovács Sándor Zsolt, Uzzoli Annamária, Nagy Tamás, Kiss Szabolcs, Szakács Zsolt, Imrei Marcell, Szentesi Andrea, Nagy Anikó, Fábián Attila, Hegyi Péter, Gyenesei Attila (2021) : Translating Scientific Knowledge to Government Decision Makers Has Crucial Importance in the Management of the COVID-19 Pandemic. Population Health Management. 2021 Feb;24(1):35-45. 

Fekete János Tibor, Welker Ágnes, Győrffy Balázs (2021): miRNA Expression Signatures of Therapy Response in Squamous Cell Carcinomas, Cancers, 13 (1) 63

Nagy Ádám, Pongor Sándor, Győrffy Balázs (2021): Different mutations in SARS-CoV-2 associate with severe and mild outcome, International Journal of Antimicrobat Agents, 106272

Salgado D, Armean I, Baudis M, Beltran S, Capella-Gutierrez S, Carvalho-Silva D, Dominguez Del Angel V, Dopazo J, Furlong LI, Gao B, Garcia L, Gerloff D, Gut I, Gyenesei Attila, Habermann N, Hancock JM, Hanauer M, Hovig E, Johansson LF, Keane T, Korbel J, Lauer KB, Laurie S, Leskošek B, Lloyd D, Marques-Bonet T, Mei H, Monostory Katalin, Piñero J, Poterlowicz K, Rath A, Samarakoon P, Sanz F, Saunders G, Sie D, Swertz MA, Tsukanov K, Valencia A, Vidak M, González CY, Ylstra B, Béroud C (2020): The ELIXIR Human Copy Number Variations Community: building bioinformatics infrastructure for research. F1000Research 9(ELIXIR): 1229, 2020. 

Nagy Ákos, Bátai Bence, Balogh Alexandra, Illés Sarolta, Mikala Gábor, Nagy Noémi, Kiss Laura, Kotmayer Lili, Matolcsy András, Alpár Donát, Masszi Tamás, Masszi András, Bödör Csaba (2020): Quantitative Analysis and Monitoring of EZH2 Mutations Using Liquid Biopsy in Follicular Lymphoma, Genes, 11 (7),785

Bátai Bence, Krizsán Szilvia, Gángó Ambrus, Hegyi Lajos, Csóka Monika, Erdélyi Dániel János, Csomor Judit, Kállay Krisztián, Bödör Csaba (2020): Juvenile myelomonocytic leukaemia presentation after preceding juvenile xanthogranuloma harbouring an identical somatic PTPN11 mutation, Pedratric Blood&Cancer, e28368

Pongor S. Lőrinc, Munkácsy Gyöngyi, Vereczkey Ildikó, Pete Imre, Győrffy Balázs (2020): Currently favored sampling practices for tumor sequencing can produce optimal results in the clinical setting, Scientific reports, 14403

Fodor István, Urbán Péter, Kemenes György, Koene M Joris, Pirger Zsolt (2020): Aging and disease‑relevant gene products in the neuronal transcriptome of the great pond snail (Lymnaea stagnalis): a potential model of aging, age‑related memory loss, and neurodegenerative diseases, Intervertebrae Neuroscience, 20:9

Fodor István, Zrinyi Zita, Horváth Réka, Urbán Péter, Herczeg Róbert, Büki Gergely, Koene M Joris, Tsai Pei-San, Pirger Zsolt (2020): Identification, presence, and possible multifunctional regulatory role of invertebrate gonadotropin-releasing hormone/corazonin molecule in the great pond snail (Lymnaea stagnalis), General and Comparative Endocrinology, (299) 113621

Fekete János Tibor, Ősz Ágnes, Pete Imre, Nagy Richárd Gyula, Vereczkey Ildikó, Győrffy Balázs (2020): Predictive biomarkers of platinum and taxane resistance using thetranscriptomic data of 1816 ovarian cancer patients, Gynecologic Oncology, 156 (2020) 654–661

Bálint Bálint László, Scholtz Beáta (2020): Teaching Bioinformatics for Students of Life Science on the GALAXY Platform, Magyar Tudomány, 181 (2020) 1, 116–120

Bartha Áron, Győrffy Balázs (2019): Comprehensive Outline of Whole Exome Sequencing Data Analysis Tools Available in Clinical Oncology, Cancers (Basel), 2019 Nov 4;11(11)

Mészáros Bálint, Dobson László, Fichó Erzsébet, Simon István (2019):Sequence and Structure Properties Uncover the Natural Classification of Protein Complexes Formed by Intrinsically Disordered Proteins via Mutual Synergistic FoldingInternational Journal of Molecular Sciences 2019 Nov 1;20(21)

Mentes Anikó, Magyar Csaba, Fichó Erzsébet, Simon István (2019): Analysis of Heterodimeric “Mutual Synergistic Folding”-ComplexesInternational Journal of Molecular Sciences, 2019 Oct 16;20(20)

Menyhárt Otilia, Fekete János Tibor, Győrffy Balázs (2018): Demographic shift disproportionately increases cancer burden in an aging nation: current and expected incidence and mortality in Hungary up to 2030Clinical Epidemiology, 2018 Aug 29; 10:1093-1108.

Ősz Ágnes, Pongor Lőrinc Sándor, Szirmai Danuta, Győrffy Balázs (2017): A snapshot of 3649 Web-based services published between 1994 and 2017 shows a decrease in availability after 2 yearsBriefings in Bioinformatics, bbx159