Eszköz szolgáltatások (tools services)

A magyar ELIXIR Node vezető kutatói által fejleszetett eszköz szolgáltatások:

• UniTmp: A transzmembrán fehérjék topológiáját és struktúráját feldolgozó eszközök:

  • Constrained Consensus TOPology prediction (CCTOP, http://cctop.enzim.ttk.mta.hu/),

  • Transmembrane helices and protein topology prediction (HMMTOP, http://www.enzim.hu/hmmtop/),

  • Detection of transmembrane regions (TMDET, http://tmdet.enzim.hu/)

  • Transmembrane proteins’ membrane segments folding recognizing (TmFoldWeb, http://tmfoldweb.enzim.ttk.mta.hu/web/).

• IUPred: Rendezetlen fehérje régiók meghatározására szolgáló eszköz (http://iupred.enzim.hu/)

• Kaplan-Meier plotter: meta-analízis alapú, tumor biomarker becslésére szolgáló eszköz (http://kmplot.com/),

• ANCHOR: Rendezetlen fehérje kötő régiók meghatározására szolgáló eszköz (http://anchor.enzim.hu/)

• IsoMut: izogén mintacsoportokban előforduló egyedi mutációk (SNP, deléció, inszerció) meghatározására szolgáló eszköz (http://www.genomics.hu/tools/isomut/isomut.html)

• Kooplex: kutatóegységek együttműködését segítő virtuális infrastruktúra hálózat (https://kooplex.vo.elte.hu/)

• MÉTA Program: a hazai természetközeli növényzet mai állapotának teljeskörű felmérése, a természetes növényzeti örökségünk tudományos értékelésére szolgáló program (https://www.novenyzetiterkep.hu/)

• G-2-O: mutáció vagy CNV, génexpresszió és a túlélés összekapcsolt vizsgálatára szolgáló eszköz (http://www.g-2-o.com/)

• Recurrence Online: transzkriptom alapú emlő tumor diagnosztikai eszköz (http://www.recurrenceonline.com/)

• ROC plotter: génexpresszió alapján prediktív biomarkerek azonosítása és validálása szolid tumorokban (http://www.rocplot.org)