Az ELIXIR vezető kutatójának csoportja határozta meg a koronavírus genomját

A Dr. Gyenesei Attila, az ELIXIR technológiai koordinátora által vezetett Bioinformatikai Kutatócsoportnak (PTE SzKK) sikerült Magyarországon először meghatároznia a koronavírus genomját. A csoportból  Urbán Péter és Tóth Gábor Endre a szekvenálási (NGS), míg Dr. Herczeg Róbert az adatfeldolgozási, kiértékelési folyamatokban vett részt.

Galaxy Admin Training - beszámoló

A Galaxy Admin Training március 2-6. között került megrendezésre Barcelonában, melyen a TTK részéről Fekete János PhD hallgató vett részt. A kurzuson jelen lévők a Galaxy szerverek installálásával, adminisztrálásával kapcsolatos elméleti és gyakorlati képzésben részesültek.

Galaxy HTS Data analysis képzés - beszámoló

A Freiburgban 2020. február 17-21. között megrendezésre került ''Galaxy HTS data analysis '' című képzésen részt vett Győrffy Balázs kutatócsoportjából Dr. Menyhart Otília tudományos munkatárs, melynek keretén belül a Chipseq, RNAseq, HiC során keletkező adatok feldolgozásával, metilációs mintázatok kiértékelésének módszereivel illetve adatvizualizációs eszközök használatával ismerkedtek meg a résztvevők. 

ELIXIR-CONVERGE Kick Off Meeting - beszámoló

2020. február 25-én Brüsszelben került sor az ELIXIR-CONVERGE pályázatot elindító gyűlésre, melyen Prof. Dr. Győrffy Balázs képviselte a magyar résztvevőket. A találkozón szó esett a munkacsomagok részfeladataihoz tartozó teendőkről, mérföldkövekről és beszámolási határidőkről, valamint a június 11. (Amszterdam, Hollandia) pályázati találkozóig megvalósítandó és elérendő célokról.

 

Fókuszban az oktatás és szerverfejlesztés

A januárban tartott vezetőségi gyűlés (2020. 01.24. Pécs, SzKK)  központi témája a hazai bioinformatika oktatás egységesítése, valamint a GALAXY, EGA, Beacon szerverek fejlesztése, infrastrukturális kalakítása volt. 

Containers and Workflow Pipelines for reproducible and automated data analysis kurzus

Elérhetőek még szabad helyek a Gentben (Belgium) 2020. május 11-12-én megrendezésre kerülő kurzusra! A VIB Bioinformatics Core szervezésében lezajló kétnapos rendezvény elsősorban olyan kutatóknak, bioinformatikusoknak szól, akiknek még nincs, vagy kevés a tapasztalatuk a container és pipeline rendszerekkel.

 

 

 

Travel Grant pályázati lehetőség

2020. december 15-ig lehet pályázni ELIXIR eseményekre való, illetve a Node-ok és a Node - Hub közötti utazás költségeinek megtérítésére, melyhez 100.000 EUR forrás áll rendelkezésre.  A támogatás fedezi a részvételi díjat, utazási és étkezési költségeket is. Pályázni All Hands, Annual Platform F-2-F, RDA Plenary meetingek költségeinek fedezésére nem lehet. 

Mivel a pályázás folyamatos, a keret kimerülése miatt hamarabb lezárásra kerülhet a pályázat.

Oldalak